Bonjour,
si vous venez avec votre voiture personnelle, il suffit d’être couvert pour le transit dans ces pays donc cela figure sur votre carte verte. Demandez à votre assureur si vous avez un doute. Dans le cas où vous n’auriez pas cette option, vous pourrez la souscrire auprès de la douane.
Si vous voyagez en voiture de location en Croatie, en Bosnie, au Montenegro et en Slovénie, vous devrez souscrire à une autorisation de territoire qui est souvent payante dans la majorité des agences internationales. Elle est comprise chez les agences de location de voiture croates que je recommande sur cette page.

https://voyages.ideoz.fr/location-voiture-croatie-en-ligne/

Il n’y a donc rien à payer aux frontières.
L’assurance souscrite auprès de l’agence est gérée par celle-ci. Les douaniers n’ont rien à vous demander pour le passage.